스푸키 파일 시즌 2

스푸키들이 떠난 후, 여전히 스푸키를 그리워하던 버트는 우연히 집 근처에서 처음 보는 스푸키를 발견하지만 스푸키는 버트의 얼굴에 콧물을 뿜는다. 스푸키의 콧물을 맞은 버트는 모두의 기억속에서 사라져 버리고 만다.

카오스가 공포의 차원으로 통하는 포털을 열자 이상하게 생긴 눈알 스푸키가 튀어나온다. 스푸키 크루는 두 팀으로 나뉘어 눈알을 잡고 스푸키를 안전하게 돌려보낼 방법을 궁리한다.

고등학교 오리엔테이션이 있는 중요한 날, 빌리와 데릭은 학교로 향하고 버트와 지나는 스푸키 본부를 재구축하느라 정신이 없다. 하지만 새롭게 나타난 스푸키는 시간을 조정해 모든 걸 되돌려 놓기 시작한다.

로비나의 13살 생일 파티가 열린 날, 파티에 온 아이들이 하나둘 잠에 빠진다. 이상함을 느낀 스푸키 크루는 스푸키의 소행을 의심하고 로비나의 생일을 망치지 않기 위해 스푸키를 잡으러 나선다.

학교 소풍을 가게 된 스푸키 크루. 하지만 빌리는 13살이 되면 스푸키를 보지 못하게 될까 봐 걱정한다. 하필이면 스푸키 파일과 존의 연기 노트가 뒤바뀌어 버리고 새로운 스푸키의 영향으로 다른 스푸키 크루들이 정신이 팔려 버리자 빌리 혼자서 해결하기로 마음 먹는다.

빌리와 버트의 여동생 피넛이 태어나는 날, 버트는 자꾸만 어리광을 부리지만 그것도 잠시뿐, 잔뜩 성이 난 아기 스푸키가 나타나 사람들을 어린아이로 만들어 버리고 버트는 투정 부리는 에드와 빌리를 챙기기 시작한다.

존과 존은 수입을 늘리기 위해 오디션을 열어 재능 있는 가수를 발굴하고 스푸키 본부를 녹음실로 바꾸려고 한다. 위기에 처한 스푸키 크루는 자기들이 오디션에 나가 우승하기로 마음먹는다. 하지만 노래를 훔치는 스푸키가 나타나고 이를 버트 혼자만 눈치챈다.

대마왕 스푸키가 오기 전에 포털을 드러낼지 말지 스푸키 크루 사이에서 의견이 분분한 가운데, 수영 축제가 시작된다. 즐겁게 수영을 시작한 아이들 틈으로 문어처럼 생긴 무시무시한 스푸키가 나타나고, 스푸키 크루는 스푸키를 잡고 축제를 살리기 위해 여러 꾀를 낸다.

대망의 서니밸리 초등학교 졸업식이 열리는 날. 하지만 포털을 통해 대마왕이 등장하고 지나가 이를 목격한다. 버트와 제스는 본부를 지키기로 하고 지나는 빌리와 데릭에게 경고하기 위해 졸업식 장소로 향하는데 때마침 대마왕이 졸업식장에 등장한다.

스푸키 탐지기를 손에 넣은 대마왕은 스푸키들을 작은 물건으로 만들고 그들의 능력을 뺏는다. 스푸키 크루가 많은 능력을 갖게 된 대마왕을 상대하는 건 역부족이지만 때마침 지원군이 도착해 스푸키 크루를 돕는다.