
사키의 어머니가 불균형한 식습관 때문에 걸리는 각기병을 앓고 있는 듯하다는 소식을 들은 진. 직접 방문해 진찰을 한다. 한편, 교토에 있던 료마가 진을 찾아와 도움을 구한다.
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도토대학 부속병원의 뇌외과 의사 "미나가타 진"은 어느 날 밤 응급실에 실려온 남자의 뇌에서 종양을 제거하고 나서부터 두통과 환청에 시달린다. 중환자실에서 탈출한 환자를 말리려다 계단에서 균형을 잃고 그대로 기절한다. 의식을 되찾은 진이 주위를 둘러보니, 사무라이들이 서로 싸우고 있다. 진은 분큐 2년(1862년), 막부 말기 에도 시대로 타임슬립 한 것이다. 그곳에서 진은 과거 사람들의 운명이나 역사를 거스르게 되는 걸 자각하면서도, 사람들을 구하기 위해 현대의 지식과 막부 말 사람들의 도움으로, 근대 의료를 실천해 나간다.

사키의 어머니가 불균형한 식습관 때문에 걸리는 각기병을 앓고 있는 듯하다는 소식을 들은 진. 직접 방문해 진찰을 한다. 한편, 교토에 있던 료마가 진을 찾아와 도움을 구한다.
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각기병으로 의심되는 증상을 앓는 황녀를 치료하면 역사에 개입하게 되는 것은 아닌지 진은 우려한다. 그러던 중, 오랜 지인이 진 앞에 나타난다.
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본인이 저지르지 않은 범죄 때문에 감옥에 갇힌 진은 혹독한 생활과 고문을 견뎌낸다. 료마와 쿄타로는 진의 무죄를 입증하기 위해 노력한다.
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인우당의 의사들이 페니실린을 분말 형태로 만들기 위해 계속 실험을 한다. 타키가 진에게 지체 높은 가문의 부인을 치료해 달라고 부탁한다.
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심한 납 중독으로 사지가 마비된 유명 가부키 배우. 진은 그가 마지막으로 한 번만 더 무대에 설 수 있게 최선을 다해 돕는다.
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페니실린에 관한 강의를 하기 위해 나가사키를 찾은 진. 그곳에서 료마와 재회하지만, 료마가 어딘가 달라졌다고 느낀다.
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노카제의 혼례식에 초대받은 사키와 진은 요코하마로 간다. 그리고 진을 만난 노카제는 자신을 진찰해 달라고 부탁한다.
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료마는 대정봉환을 실현하기 위해 분주히 움직인다. 한편, 진은 열심히 노력하는 노카제와 아기의 생명을 모두 구하기 위한 방법을 고민한다.
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진이 료마의 암살을 막기 위해, 사키, 사부리와 함께 황급히 교토로 향한다. 같은 시각, 쿄타로 역시 완전히 다른 임무를 띠고 같은 곳으로 가고 있었다.
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진, 사키, 사부리가 료마의 생명을 구하기 위해 대수술을 한다. 한편, 인우당의 의사들은 가짜 페니실린 제조법을 가르쳤다는 혐의로 체포된다.
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남은 시간이 많지 않다는 것을 느낀 진. 인우당의 의사들에게 본인이 가진 모든 의학 지식을 전하기로 한다. 한편, 쿄타로는 힘든 결단을 내린다.
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